Behandlingen skjer ved å kombinere leddbehandling (manipulasjons- og mobiliseringsteknikker) med ulike former for muskelbehandling, som vanligvis følges opp med individuelt tilpassede treningsøvelser og ergonomisk rådgivning.
En naprapat leter alltid etter den underliggende årsaken til smerten og ser på kroppen som en helhet. Dette fokuset, hvor ortopedisk manuell medisin kombineres med en spesifikk kunnskap om kroppens oppbygging av muskler, sener, skjelett, ledd, bindevev og nervesystem kjennetegner naprapatien.
Studiet har sitt hovedfokus på anatomi, fysiologi, nevrologi, ortopedi, idrettsmedisin, rehabilitering og naprapati. Halve studiet er på denne måten inndelt i humanbiologiske og medisinske studier, og den andre halvdelen omfatter spesialiseringen innenfor naprapati.